<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=utf-8" http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    There is a way to have the existing code generation web service go
    to a non-standard repository (or for that matter, any web-accessible
    EML document). <a class="moz-txt-link-freetext"
      href="http://www.vcrlter.virginia.edu/data/eml2/PASTAprogWebService.pdf">http://www.vcrlter.virginia.edu/data/eml2/PASTAprogWebService.pdf</a>
    has all the nitty-gritty. <br>
    <br>
    I could also easily write a version of the web service that points
    to PASTA-S instead of PASTA if there is demand for it...<br>
    <br>
     -John Porter<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 2/23/2016 12:38 PM, Brian Herndon
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:BLUPR02MB357B06BD5BB5EBC8BD2B751C5A40@BLUPR02MB357.namprd02.prod.outlook.com"
      type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
      <meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered
        medium)">
      <style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman",serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
p
        {mso-style-priority:99;
        mso-margin-top-alt:auto;
        margin-right:0in;
        mso-margin-bottom-alt:auto;
        margin-left:0in;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman",serif;}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
      <div class="WordSection1">
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Mark,<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Is
            there any way to have this code generated for datasets
            uploaded to the portal-S?  When you try to download the
            codes an URL error is returned because the metadata is not
            in the primary PASTA repository.  A feature like this in
            portal-S would be helpful for researchers to have something
            to work with on their embargoed data.<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><b><span
              style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif">From:</span></b><span
style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif"> im
            [<a class="moz-txt-link-freetext" href="mailto:im-bounces@lists.lternet.edu">mailto:im-bounces@lists.lternet.edu</a>]
            <b>On Behalf Of </b>Mark Servilla<br>
            <b>Sent:</b> Tuesday, February 23, 2016 12:19 PM<br>
            <b>To:</b> Jonathan Walsh
            <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:walshjcaryinstitute@gmail.com"><walshjcaryinstitute@gmail.com></a><br>
            <b>Cc:</b> IM committee <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:im@lternet.edu"><im@lternet.edu></a><br>
            <b>Subject:</b> Re: [LTER-im] MATLAB script inclusion?<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <div>
          <p class="MsoNormal">Hi Jonathan,<br>
            <br>
            The "analyze with R, Matlab, SAS...' option automatically
            generates the appropriate script (to the best of XSLTs
            ability) based on the EML metadata for that specific data
            package, so including a separate script is not an option.
            This process is executed on a server at VCR (the wonder of
            web services), courtesy of John Porter, and with the help of
            the Workflow Working Group. You may, however, include the
            script as part of the data package and document the script
            within the EML as "software".<o:p></o:p></p>
          <div>
            <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
          </div>
          <div>
            <p class="MsoNormal">I hope this helps.<o:p></o:p></p>
          </div>
          <div>
            <p class="MsoNormal"><br>
              Sincerely,<br>
              Mark<o:p></o:p></p>
          </div>
        </div>
        <div>
          <p class="MsoNormal"><br clear="all">
            <o:p></o:p></p>
          <div>
            <div>
              <p class="MsoNormal"><br>
                ---<br>
                Mark Servilla<br>
                <a moz-do-not-send="true"
                  href="mailto:mark.servilla@gmail.com" target="_blank">mark.servilla@gmail.com</a><o:p></o:p></p>
            </div>
          </div>
          <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
          <div>
            <p class="MsoNormal">On Tue, Feb 23, 2016 at 9:54 AM,
              Jonathan Walsh <<a moz-do-not-send="true"
                href="mailto:walshjcaryinstitute@gmail.com"
                target="_blank">walshjcaryinstitute@gmail.com</a>>
              wrote:<o:p></o:p></p>
            <blockquote style="border:none;border-left:solid #CCCCCC
              1.0pt;padding:0in 0in 0in
              6.0pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0in">
              <p>I see my data sets when viewed via the network portal
                have an analyze with R, Matlab, SAS...' etc option.  Can
                I actually include the script we use for this dataset?<o:p></o:p></p>
              <p>Thank you!<o:p></o:p></p>
              <p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><br>
                _______________________________________________<br>
                Long Term Ecological Research Network<br>
                im mailing list<br>
                <a moz-do-not-send="true" href="mailto:im@lternet.edu">im@lternet.edu</a><br>
                <br>
                <o:p></o:p></p>
            </blockquote>
          </div>
          <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        </div>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Long Term Ecological Research Network
im mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:im@lternet.edu">im@lternet.edu</a>

</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>